直属机构

阿坝州自然保护地工作站（简称州自然保护地工作站）挂阿坝州世界遗产保护中心（简称州世界遗产保护中心）牌子，主要职责是：承担自然保护地生物多样性调查、生态监测、科学研究、自然教育工作。组织开展自然保护地能力、绩效和生态状况的评估工作。承担保护世界文化和自然遗产公约履约工作。

阿坝州林业和草原有害生物防治检疫站（简称州林草防治检疫站）主要职责是：组织、指导、检查全州森林植物及其产品的检疫和全州森林病虫鼠害防治工作。

阿坝州草原监理站（简称州草原监理站）主要职责是：负责全州草原保护利用、草原生态保护修复技术推广应用和草原病虫鼠害防治及检测工作。
    阿坝州野生动物资源调查保护站（简称州野保站）挂阿坝州野生动物疫源疫病监测站（简称州野生动物疫源疫病监测站）牌子。主要职责是：宣传贯彻野生动植物资源保护法律法规政策，组织实施全州野生动植物资源调查、类别鉴定、保护利用、疫源疫病监测。

阿坝州木材检查站（简称州木检站）主要职责是：负责宣传、执行林业法律法规和国家、省、州有关木材运输检查监督的法规政策；依法检查运输木材、林产品和野生动物、植物及其产品运输证件，制止违法运输；在授权、委托范围内查处违法运输的木材、林产品和野生动、植物及其产品。
    阿坝州森林和草原资源站（简称州林草资源站）挂阿坝州林业和草原调查规划设计队（简称州林草调查规划设计队）。主要职责是：负责编制森林经营区划方案和林木限额采伐指标；负责森林资源调查、规划和林地利用规划设计；负责审核林木采伐作业设计；开展草原资源监测工作。
    阿坝州林草种苗站（简称州林草种苗站）挂阿坝州林草种苗质量监督检查中心（简称州林草种苗质检中心）牌子。主要职责是：负责组织林草种子资源普查，林草良种选育推广，林草种苗质量监督检测，林草种子储备工作。

阿坝州天然林保护中心（简称州天保中心）挂阿坝州国有林和公益林保护中心（简称州国有公益林保护中心）牌子。主要职责是：负责宣传贯彻执行国家、省、州有关天然林保护的方针、政策、法律法规；负责全州天然林保护工程管理办法、长远规划、年度计划编制和组织实施相关工作；负责全州公益林管理和公益林生态效益补偿的组织实施相关工作；承担全州国有林保护相关工作。
    阿坝州退耕还林还草中心（简称州退耕中心）挂阿坝州荒漠化防治中心（简称州荒漠化防治中心）牌子。主要职责是：负责组织实施全州退耕还林还草工程，负责政策宣传、总体规划、计划申报、技术服务等工作；组织开展科技示范，先进管理经验总结推广；指导后续产业发展，巩固退耕还林成果。
    阿坝州林业和草原科学技术研究所（简称州林草研究所）主要职责是：围绕全州林业和草原生产及产业发展对科学技术的需要，大力引进、消化、吸收、推广应用先进科技和实用技术、加强对新品种、新技术的引进和先进技术集成，为全州林业和草原生产及产业发展提供科级服务。